16S/18S/ITS Microbiome Analysis
마이크로바이옴 분석
16S/18S/ITS 마이크로바이옴 분석 서비스
16S/18S/ITS 마이크로바이옴 분석 서비스란 ?
16S/18S/ITS 마이크로바이옴 분석은 샘플 내에 존재하는 다양한 미생물/진핵생물/곰팡이의 구성과 분포를 분석하는 서비스입니다.
분석영역
분석 대상 생물군 | 분석 영역 |
|---|---|
Archaea, Bacteria | 16S V1V2 |
16S V3V4 | |
16S V4 | |
Eukaryote
| 18S V3V4 |
18S V9 | |
Fungi
| ITS1
|
ITS2
|
기본 분석 항목
(※ ITS2 영역에 대한 분석의 경우, * 표시된 항목은 결과에서 제외됩니다.)
1. NGS QC Data
2. Taxonomic Distribution
– Bar plots for relative ratio of microbes in phylum, class, order, family, genus, and species level
3. Alpha Diversity
– Chao1, Observed Species, Shannon Index, Simpson Index, PD Whole Tree*
4. Rarefaction Curves
– Chao1, Observed Species, Shannon Index, Simpson Index, PD Whole Tree*
5. Beta Diversity
– Bray-Curtis*, Unweighted Unifrac*, Weighted Unifrac*
6. UPGMA Trees
– Bray-Curtis*, Unweighted Unifrac*, Weighted Unifrac*
추가 분석 항목
1. LEfSe 2. XOR 3. PICRUSt
Experimental Data
